La collection des autographes comprend plus de 200 cartons contenant 50 000 pièces autographes (lettres isolées et manuscrits non reliés) : il s’agit de manuscrits et de lettres autographes d’artistes, de collectionneurs et de critiques d’art, qui se présentent sous forme isolée ou en ensembles cohérents (ex : Papiers Roger-Milès, Papiers René-Jean, etc.).

Les autographes se demandent par numéro de carton. Les cartons 1 à 94 ayant été microfilmés, ils ne sont consultables en original qu’à titre exceptionnel sur rendez-vous. Les cartons 1 à 43 ont été numérisés et sont consultables sur la bibliothèque numérique de l'INHA.

Les autographes sont entièrement décrits dans Calames.